Navy Seal Commander Sam Axe wird auf eine Informationsbeschaffungsmaßnahme nach Südamerika geschickt. Er soll eine Rebellengruppe ausspionieren, doch vor Ort angekommen, stellt er schnell fest, dass nichts so ist wie es scheint. Er sieht sich bald einer waffenstarrenden Armee gegenüber und hat nichts als ein paar Farmer mit alten Gewehren auf seiner Seite. Aber Sam war ja noch nie knapp an explosiven Einfälle und Ideen um Gegner zu überwältigen. Burn Notice: The Fall of Sam Axe erzählt die Geschichte des Marinekommandanten, bevor er nach Miami kam.