在迪奥的威胁结束后的一个月,各地的电脑世界陆续开始出现了异常的暖化现象。因为暖化现象的关系,导致被冰封起来的泡泡人解冻。就在此时,电脑世界里出现了一条通往“彼方世界”的次元裂缝,在裂缝旁发现了神秘的婴儿,而在那个被称为彼方世界的异界里存在着大量狂爆的病毒。 另一方面,现实世界里出现了两个实体化的电脑兽——“古雷加”和“法尔札”,两只电脑兽互相厮打并开始破坏街道。网路救星热斗、炎山和雷火虽然使用了双向融合,但还是无法阻止电脑兽。最后,两只电脑兽能量用尽,退回电脑世界后继续厮打,就在洛克人、布鲁斯和侦察人束手无策之际,神秘的婴儿突然和洛克人融合,洛克人的外观竟然转变成野兽姿态,并以超强的威力击倒了两只电脑兽。 在这之后,接连出现了自称为兽裔生命体的领航员及兽化病毒。神秘事件接踵而来,到底彼方世界是个怎样的世界?那两只电脑兽和兽裔生命体他们的目的为何?那个神秘婴儿的真面目是什么?还有兽化洛克人到底存在什么秘密?热斗与洛克人将在充满漩涡般的谜团中展开新的战斗。